1958年，中共吉安地委根据中共中央、国务院和江西省委的指示，在吉安市创办了吉安工学院、吉安农学院、吉安医学院和吉安师范学院四所高等学校。同年12月，地委决定四所学校合并，成立井冈山大学。经江西省人民委员会批准，1959年7月1日正式命名为井冈山大学。1963年7月，由于国家经济困难而停办。
     1977年10月，经江西省人民政府批准，在原井冈山大学的基础上，建立了江西师范学院井冈山分院。1982年4月，经教育部批准设立吉安师范专科学校。2000年3月，经教育部批准，吉安师范专科学校和吉安教育学院合并组建井冈山师范学院。
     1978年8月，经江西省人民政府批准，以原井冈山大学医学院为基础，建立了江西医学院吉安分院。1993年4月，经国家教委批准更名为井冈山医学高等专科学校。
     1984年3月，经国家教委批准备案，创办吉安地区工业职工大学，1986年改名为吉安地区职工大学。与此同时，成立吉安地区工交干部学校。2002年4月，经江西省人民政府批准，成立井冈山职业技术学院。
     2003年7月9日，经教育部批准，井冈山师范学院、井冈山医学高等专科学校和井冈山职业技术学院合并，组建井冈山学院，同时筹建井冈山大学。2004年5月18日，中共江西省委宣布了井冈山学院的领导班子。2007年8月和9月，国家教育部、江西省人民政府分别批准井冈山学院更名为井冈山大学。2007年10月28日，举行了隆重的井冈山大学挂牌暨省部共同重点支持建设签约仪式。