学校实验中心严格按照国际标准实验室进行建设，实验室面积12800平方米。设有36个标准实验室和8个测试室，每个教学实验室都配有多媒体教学设施，从整体设计到各项配套设备，居全国同类院校先进水平。是教育部“国家级实验教学示范中心”，为全国医学类院校首批6个“国家级实验教学示范中心”之一。
     学校有省部共建教育部重点实验室：北药基础与应用研究国家级重点实验室；国家中医药管理局科研三级实验室10个：方药分析实验室、分子生物学实验室、中药药理（妇科）实验室、中药质量评价与血清药物化学实验室、中药化学实验室、中药材质量控制实验室、中药药理（行为）实验室、中药制剂实验室、细胞分子生物学实验室、中药毒理实验室；国家中医药管理局重点研究室3个：中药血清药物化学、方剂配伍、不孕症“证、治”重点研究室；省级重点实验室7个：天然药物药效物质基础实验室、中药血清药物化学实验室、针灸临床神经生物学实验室、中药学重点实验室、中医药基础研究实验室、中药材规范化生产与质量标准实验室和新药研究与开发实验室等。