学院设有国家体育总局体育社会科学重点研究基地、国家武术运动管理中心科研基地、上海市民体质研究中心、上海国际赛车研究中心、上海体育彩票研究中心、中国体育科学学会体育产业分会等科研实体，新建国内领先水平的运动分子生物学实验中心等高等级研究型实验室和一体化语音实验室等一批教学实验室，为科研工作提供平台。学院科研工作坚持为教学、训练和社会服务的原则，承担的国家级、省（市）部级课题和奥运攻关服务类课题逐年增加，获得各类奖项数十项，并开创了我国体育学术论文进入 SCI 零的突破。