学校前身是中国共产党1947年在鸡西建立的东北第一所煤矿工人干部学校。1954年与鹤岗煤矿学校合并成立鸡西煤矿学校，1958年在此基础上成立鸡西矿业学院，1964年部分并回鸡西煤矿学校，部分与其他院校合并成立阜新煤矿学院，1978年复建鸡西矿业学院，1981年改称黑龙江矿业学院。
    
     1998年以前，学校隶属于原国家煤炭工业部，主要面向煤炭行业办学。1998年高等教育管理体制改革后，隶属关系实行中央与地方共建，以黑龙江省管理为主。2000年经教育部批准更名为黑龙江科技学院，2003年主体迁入哈尔滨市。