学校具有50多年的办学历史。她的前身是建立于1958年的广东省卫生干部进修学院。1978年经国务院批准，升格为普通本科学校，定名为"广东医药学院"。1994年2月，为了适应广东经济进一步发展要求，更名为"广东药学院"，成为继中国药科大学、沈阳药科大学之后，我国的第三所独立建制的高等药科学校。