广东药学院现设有国家中医药管理局二级实验室、广东省药物新剂型重点实验室、广东省科教兴医重点实验室、广东省教育厅现代中药重点实验室等4个国家和省级研究机构，以及药物研究所、中药开发研究所、生物制药研究所。