学校前身是创办于1963年的福建第二师范学院，1966年因文化大革命停办，1970年被撤销。1977年以来，在福建省委、省政府和漳州市委、市政府的高度重视下，重选校址，重建校园，先后经历了龙溪地区中学师资培训班、龙溪师范大专班、漳州师范高等专科学校的办学历程。1986年经原国家教委批准复办福建第二师范学院，并更名为漳州师范学院，与福建师范大学形成福建省 “一南一北”的本科教师教育格局。1992年获得学士学位授予权，2000年顺利通过国家教育部首批师范院校本科教学工作合格评估，2003年增列为硕士学位授予权单位。2008年以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估，2009年以唯一一所两轮满票的成绩通过全国教育硕士专业学位教育指导委员会的专家评审，获教育硕士授予权。